Олимпиадата през 1906 г. в Атина се оказа необикновена, тъй като организаторите й не спазиха изискването за традиционна четиригодишна почивка между игрите. Поради тази причина Олимпиадата дори не беше официално призната от Международния олимпийски комитет.
Игрите от 1906 г. се провеждат в чест на десетата годишнина от първата Олимпиада, която също се проведе в Атина. За да подчертаят допълнително връзката между двете събития, организаторите на Олимпиадата избраха същата схема на състезание като през 1896 година. В по-голямата си част състезанията се провеждаха на стадион "Мрамор".
Отначало, когато от Гърция дойде предложение за домакин на олимпиадата през 1906 г., МОК не даде категоричен отказ. Факт е, че по това време престижът на Олимпийските игри падна и обществеността вече не проявяваше бившия си интерес към тях. За да се предотврати окончателният крах на олимпийското движение, беше необходимо да се вземат мерки и вече не беше възможно да се чака до 1908 година. И въпреки че впоследствие МОК отказва да признае Олимпиадата през 1906 г., това ще бъде наречено спасението на игрите, което позволи да се върне интереса на обществеността и най-вече на спортистите към събитието, за да се подкрепи движението и самата му идея.
Трудността беше и в това, че според традицията Олимпиадата трябваше да се проведе в различни страни по света, но през 1906 г. се предвиждаше събитието да се проведе в Гърция, което предизвика недоволство на членовете на МОК. Така или иначе, но на 22 април се проведе голямото откриване на игрите. Тъй като медиите обърнаха много внимание на Олимпийските игри през 1906 г., много спортисти и гости пристигнаха в Атина.
На събитието присъстваха около 900 спортисти от 20 държави, сред които седем жени. В рамките на Олимпиадата от 1906 г. се провеждат състезания в следните спортове: вдигане на тежести, гръко-римска борба, фехтовка, гребане, ветроходство, плуване, гмуркане, лека атлетика, стрелба с пейка и куршуми, колоездене и тенис. За съжаление, тъй като МОК не призна олимпийските игри през 1906 г., всички награди, получени от неговите участници, бяха невалидни и не бяха взети под внимание в бъдеще.
Церемонията по закриването на олимпиадата се проведе на 2 май. След събитието резултатите от него бяха обсъждани дълго време в различни страни, което значително увеличи обществения интерес към игрите. Това стана особено забележимо по време на Олимпийските игри в Лондон през 1908 г., в които участваха повече от 2000 спортисти.
